1. 特许权使用费允许扣除吗
根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（中华人民共和国国务院令第512号）的规定，企业之间支付的管理费、企业内营业机构之间支付的租金和特许权使用费，以及非银行企业内营业机构之间支付的利息，不得扣除。
2. 特许权使用费所得税费如何扣除
计算应来纳税所得额时允许扣除的税源费，只适用于劳务报酬所得、特许权使用费所得、财产租赁所得和财产转让所得项目。特许权使用费允许扣除的税费是指提供特许权过程中发生的中介费和相关税费。
例3-46?计算李某为某企业技术人员，2018年12月转让一项业余开发的技术使用权取得净收入13000元（已扣除合法中介费1500元）。当月出租私房给他人居住取得租金2000元，交纳相关地方税费及附加110元。
请计算其当月应纳的个人所得税。
【解析】个人从事技术转让所支付的中介费，若能提供合法凭证，允许从其所得中扣除。
技术转让收入应纳税额=[13000-（13000+1500）×20%]×20%=2020（元）；（2 000-800-110）×10%=109（元）。
当月应纳个人所得税=2020+109=2129（元）。
3. 用境外关联方无形资产支付特许权使用费可否税前扣除
根据《国家税务总来局关于企源业向境外关联方支付费用有关企业所得税问题的公告》（国家税务总局公告2015年第16号）第五条规定，企业使用境外关联方提供的无形资产需支付特许权使用费的，应当考虑关联各方对该无形资产价值创造的贡献程度，确定各自应当享有的经济利益。企业向仅拥有无形资产法律所有权而未对其价值创造做出贡献的关联方支付特许权使用费，不符合独立交易原则的，在计算企业应纳税所得额时不得扣除。
4. 特许权使用费可否计入研发费用享受加计扣除
高新技术企业在每年的所得税汇算清缴过程中，可以将当年企业发生的研发费用回按150%加计扣除。比如：当年答发生的研发费用100万元，则当年可在税前扣除的研发费用是150万元。这是对高新技术企业的特殊优惠政策。当然在享受加计扣除政策前，企业首先要能对研发费用单独核算，其次加计扣除前需要到税务机关备案登记。
5. 特许权使用费可否计入研发费用享受加计扣除
企业开展研发活动中实际发生的研发费用，未形成无形资产计入当期损益的，在按规定据实扣除的基础上，按照本年度实际发生额的50%，从本年度应纳税所得额中扣除；形成无形资产的，按照无形资产成本的150%在税前摊销。研发费用的具体范围包括：
1.人员人工费用。
直接从事研发活动人员的工资薪金、基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金，以及外聘研发人员的劳务费用。
2.直接投入费用。
（1）研发活动直接消耗的材料、燃料和动力费用。
（2）用于中间试验和产品试制的模具、工艺装备开发及制造费，不构成固定资产的样品、样机及一般测试手段购置费，试制产品的检验费。
（3）用于研发活动的仪器、设备的运行维护、调整、检验、维修等费用，以及通过经营租赁方式租入的用于研发活动的仪器、设备租赁费。
3.折旧费用。
用于研发活动的仪器、设备的折旧费。
4.无形资产摊销。
用于研发活动的软件、专利权、非专利技术（包括许可证、专有技术、设计和计算方法等）的摊销费用。
5.新产品设计费、新工艺规程制定费、新药研制的临床试验费、勘探开发技术的现场试验费。
6.其他相关费用。
与研发活动直接相关的其他费用，如技术图书资料费、资料翻译费、专家咨询费、高新科技研发保险费，研发成果的检索、分析、评议、论证、鉴定、评审、评估、验收费用，知识产权的申请费、注册费、代理费，差旅费、会议费等。此项费用总额不得超过可加计扣除研发费用总额的10%。
7.财政部和国家税务总局规定的其他费用。
6. 允许加计扣除扣除范围是怎么规定的
建立研发专账，允许加计扣除的项目及标准有但不限于以下几项
1、人员人工
从事研究开发活动人员（也称研发人员）全年工资薪金，包括基本工资、奖金、津贴、补贴、年终加薪、加班工资以及与其任职或者受雇有关的其他支出。
2、直接投入
企业为实施研究开发项目而购买的原材料等相关支出。
如：水和燃料（包括煤气和电）使用费等；
用于中间试验和产品试制达不到固定资产标准的模具、样品、样机及一般测试手段购置费、试制产品的检验费等；
用于研究开发活动的仪器设备的简单维护费；
以经营租赁方式租入的固定资产发生的租赁费等。
3、折旧费用与长期待摊费用
包括为执行研究开发活动而购置的仪器和设备以及研究开发项目在用建筑物的折旧费用，包括研发设施改建、改装、装修和修理过程中发生的长期待摊费用。
4、设计费用
为新产品和新工艺的构思、开发和制造，进行工序、技术规范、操作特性方面的设计等发生的费用。
5、装备调试费
主要包括工装准备过程中研究开发活动所发生的费用（如研制生产机器、模具和工具，改变生产和质量控制程序，或制定新方法及标准等）。
为大规模批量化和商业化生产所进行的常规性工装准备和工业工程发生的费用不能计入。
6、无形资产摊销
因研究开发活动需要购入的专有技术（包括专利、非专利发明、许可证、专有技术、设计和计算方法等）所发生的费用摊销。
7、委托外部研究开发费用
是指企业委托境内其他企业、大学、研究机构、转制院所、技术专业服务机构和境外机构进行研究开发活动所发生的费用（项目成果为企业拥有，且与企业的主要经营业务紧密相关）。委托外部研究开发费用的发生金额应按照独立交易原则确定。
认定过程中，按照委托外部研究开发费用发生额的80％计入研发费用总额。
8、其他费用
为研究开发活动所发生的其他费用，如办公费、通讯费、专利申请维护费、高新科技研发保险费等。此项费用一般不得超过研究开发总费用的10％，另有规定的除外。
7. 企业委托外部机构或个人进行研发活动所发生的费用，是否允许加计扣除
一、根据《财政部 国家税务总局 科技部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》(财税〔2015〕119号)规定：“二、特别事项的处理
1.企业委托外部机构或个人进行研发活动所发生的费用，按照费用实际发生额的80%计入委托方研发费用并计算加计扣除，受托方不得再进行加计扣除。委托外部研究开发费用实际发生额应按照独立交易原则确定。
委托方与受托方存在关联关系的，受托方应向委托方提供研发项目费用支出明细情况。
企业委托境外机构或个人进行研发活动所发生的费用，不得加计扣除。
......
六、执行时间
本通知自2016年1月1日起执行。”
二、根据《国家税务总局关于企业研究开发费用税前加计扣除政策有关问题的公告》(国家税务总局公告2015年第97号)规定：“ 三、委托研发
企业委托外部机构或个人开展研发活动发生的费用，可按规定税前扣除;加计扣除时按照研发活动发生费用的80%作为加计扣除基数。委托个人研发的，应凭个人出具的发票等合法有效凭证在税前加计扣除。
企业委托境外研发所发生的费用不得加计扣除，其中受托研发的境外机构是指依照外国和地区(含港澳台)法律成立的企业和其他取得收入的组织。受托研发的境外个人是指外籍(含港澳台)个人。
......
八、执行时间
本公告适用于2016年度及以后年度企业所得税汇算清缴。”
8. 特许权使用费可否计入研发费用享受加计扣除
1、根据《关于研究开发费用税前加计扣除政策有关问题的公告》(国家税务总局公告2015年第97号）文件，如果发生的特许权使用事项不是用于文件所界定的研究开发活动的，那么，所支付的特许权使用费不能作为研究开发费用，如果发生的特许权使用事项是用于研究开发活动的，该特许使用权确定为无形资产的，相应摊销支出可以计入研究开发费用依法加计扣除；
2、通常情况下，必须结合企业实际情形，将相应事项所涉资料提交主管税务机关予以申报、审核及备案，才可推进相应加计扣除工作；
以上仅供参考，请予核实，依法操作。
9. 特许权使用费可否计入研发费用享受加计扣除
要看具体情况，但一般是不可以的，研发费用这块是所得税汇算清缴的重点版之一，也是权审计重点关注的内容，特许权使用费属于经营成本，除非你说的特许权使用费是研发项目的必要支出是可以的，实在不确定的话建议咨询一下税务局你们的专管员。