1. 章程备案登记信息股权与实际不符有什么风险
风险还是有的，股权转让、增资等都涉及到征收企业所得税，不仅要凭会计账簿，工商、市场监管、税务机关都是有联合工作机制的，如果不及时变更登记，的确是会产生一些风险，可能不会是财产损失的风险，但是会在经营上造成麻烦。
另外就是，如果不变更登记，在经营活动中就无法对抗相对人，经营相对人通过登记了解到B公司还是股权的话，如果与A公司产生了纠纷，可能还是会让B公司来承担责任。
2. 证券资格转让协议和原有工商登记不符怎么办
股权转让协议和工商登记不符的，当事人可以及时申请公司登记机关变更登记或者更正其错误。一般自变更股东之日起三十日内，就需要向公司登记机关申请变更。
【法律依据】
《中华人民共和国公司登记管理条例》第二十七条
公司申请变更登记，应当向公司登记机关提交下列文件：
（一）公司法定代表人签署的变更登记申请书；
（二）依照《公司法》作出的变更决议或者决定；
（三）国家工商行政管理总局规定要求提交的其他文件。
公司变更登记事项涉及修改公司章程的，应当提交由公司法定代表人签署的修改后的公司章程或者公司章程修正案。变更登记事项依照法律、行政法规或者国务院决定规定在登记前须经批准的，还应当向公司登记机关提交有关批准文件。
第三十四条
有限责任公司变更股东的，应当自变更之日起30日内申请变更登记，并应当提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明。
3. 股权转让协议金额不一致，以哪个有效为准
您好，一个协议表面上看是双方的真实意思表示，而另一个是工商机关登记备案的，哪一个更版有效力，对此，权学者各说不一，一些人认为，根据我国《合同法》第五十二条规定:“有下列情形之一的，合同无效：（二）恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益；（三）以合法形式掩盖非法目的”，经工商局备案的《股权转让协议》是恶意串通，以合法形式掩盖非法目的，登记备案的协议属无效，应该采纳实际要履行的协议。
但主流认为，结合我国最高人民法院的司法解释，登记备案的合同效力高于未备案的合同效力，未登记的股权转让协议不能产生对抗第三人的效力。
如能给出详细信息，则可作出更为周详的回答。
4. 股权转让协议与工商登记的不一致怎么办
在股权转让协议抄中律师做如下提示：有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权，《股权转让协议书》系双方当事人的真实意思表示，符合自愿、公平的原则，且没有违反法律和行政法规的强制性规定以及公司章程的规定，公司股东对此亦表示一致同意，该协议自签订之日起成立并生效。此外，虽然股东转让出资要进行股东变更登记，但对于股权转让协议，法律并无必须登记才生效的规定，且股东变更登记是对股东变更的公示方式，未办理登记只是使得该股权转让行为原则上对公司以外不产生法律效力，而并不影响股权转让协议本身的效力，该协议对股权转让各方仍具有法律效力。
5. 有限责任公司的股权转让怎么做能合法公司登记机关登记的股东与实际股东不符怎么办
你们现在是隐名股东，如果想对外转让股权必须解决隐名股东显名化的问题，如果是对内转让股权，可能面临高额股权转让税费的问题。而是否能成功显名或对内转让，关键看你们和那30人之间是否有《代持股协议》及该协议的约定内容。目前比较常见的做法是，与代持股股东协商后，通过确认之诉，使隐名股东显名化，之后再办理股权转让，但如果目前公司净资产等于或低于股东当时的出资额，那么对内转让也是不错的选择。方法有很多，要根据你的具体情况选择最适合你的。如果金额较大，建议还是找专业的律师帮助，以避免因方法不当造成损失。
6. 在股东未实际出资的情况下签订了股权转让协议，并在工商备案，进行税务变更时，需要缴纳所得税吗
7. 股权转让和工商登记,股东名册发生冲突时,以那个为准
这个涉及股东身份的认定，以哪个证据作为确权的依据，股权转让协议、股东名册、出资证专明、工商登记属？首先需要弄清楚何为股东，按照公司法及其司法解释的规定，股东身份的取得可以通过依法受让股权或者履行出资义务而取得，因此，是否具备股东身份，关键性的证据是看是否依法受让了股权或者依法对公司履行了出资，这是根本。工商登记备案以及股东名册记载均是在依法受让或者出资之后随后产生的登记行为，这些登记行为本身不具有创设股东资格的效力，只具有对外宣示、公示的效果。因此，根本上讲应以股权转让作为确认股东身份的关键性证据，再综合考虑工商登记等因素而定。当然，如果没有工商登记是无法对抗善意第三人的。