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创造性酶切

发布时间:2022-03-01 10:38:34

⑴ 限制性酶酶切DNA有几种方式

第一、二、三类,其中常用为第二类限制性内切酶,酶切活性在正常条件下只有一种,在非正常条件如浓度过大、非最适温度、离子条件不适宜时,会表现出非正常酶切活性,即切点发生变化,即星活性。

⑵ 常用的酶切有哪些方法

常用的酶切方法有单酶切、双酶切和部分酶切等几种。(1)单酶切法:这是用一种限制性内切核酸酶酶切DNA样品。若DNA样品是环状DNA分子,完全酶切后,产生与识别序列数(n)相同的DNA片段数,并且DNA片段的两末端相同。若DNA样品本来就是线形DNA片段,完全酶切的结果,产生n+1个DNA片段数,其中有两个片段的一端仍保留原来的末端。

(2)双酶切法:这是用两种不同的限制性内切核酸酶酶切同一种DNA分子的方法。DNA分子无论是环状DNA分子,还是线形DNA片段,酶切结果,DNA片段的两个黏性末端是不同的(用同尾酶酶切除外)。环状DNA分子完全酶切的结果,产生的DNA片段数是两种限制性内切核酸酶识别序列数之和。线形DNA片段完全酶切的结果,产生的DNA片段数是两种限制性内切核酸酶识别序列数之和加1。

(3)部分酶切:部分酶切指选用的限制性内切核酸酶对其在DNA分子上的全部识别序列进行不完全的酶切。导致部分酶切的原因有底物DNA的纯度低、识别序列的甲基化、酶用量不足、反应时间不够以及反应缓冲液和温度不适宜等。部分酶切会影响需要的DNA片段的得率。但是从另一方面说,有时根据重组DNA的需要,还专门创造部分酶切的条件,以获得需要的DNA片段。

图4-2:DNA酶切电泳图

⑶ DNA的限制性酶切及电泳分析实验方法.

1. 反应体系的建立:⑴ 在一无菌1.5 ml Eppendorf管中加入:�无菌双蒸水 7 μl�10×酶切缓冲液 2 μl�质粒DNA(100 ng/μl) 10 μl�EcoRⅠ(5 U/μl) 1 μl�总体积为20μl⑵ 轻轻混匀,12000 rpm离心5 sec。2. 37 ℃水浴1 h。3. 将Eppendorf管置65 ℃水浴中10 min,通过加热使酶失活以终止反应。4. 12000 rpm离心5 sec,将管盖及管壁上的水离下。5. 取10 μl消化产物,与2 μl 6×上样缓冲液混匀,琼脂糖凝胶电泳检测消化效果,电泳条件:约100 V 30~60 min。6 结果观察。操作注意事项:1. 吸样量一定要准确2. 为了不使酶污染而导致浪费,最后才加酶3. 要求在冰上操作,并充分混匀,4. 开启Eppendorf管时,手不要接触到管盖内面,以防污染。5. 样品在37 ℃与65 ℃保温时,将离心管盖严,以防水进入管内造成实验失败。限制性内切酶酶解中常见的问题和原因1. DNA完全没有被限制性内切酶切割:①限制性内切酶失活;②DNA不纯,含有SDS、有机溶剂、EDTA等;③非限制性内切酶最佳反应条件;④酶切位点被修饰;⑤DNA上不存在该酶的识别顺序。2. DNA切割不完全:①限制性内切酶活性下降或稀释不正确;②DNA不纯或反应条件不佳;③酶切位点被修饰;④部分DNA溶液粘在管壁上;⑤酶切后DNA粘末端退火。3. DNA片段数目多于理论值:①限制性内切酶星号活力;②存在第二种限制性内切酶污染;③样品DNA中含有其它DNA。 可以到生物帮上查找这方面的信息啊,那里拥有生物领域内丰富的资源,有空的话,可以去 www.bio1000.com/zt/dna/164670.html 那里看下啊。

⑷ DNA限制性内切酶酶切的影响因素

当微量的污染物进入限制性内切酶贮存液中时,会影响其进一步使用,因此在吸取限制性内切酶时,每次都要用新的吸管头。如果采用两种限制性内切酶,必须要注意分别提供各自的最适盐浓度。
若两者可用同一缓冲液,则可同时水解。
若需要不同的盐浓度,则低盐浓度的限制性内切酶必须首先使用,随后调节盐浓度,再用高盐浓度的限制性内切酶水解。也可在第一个酶切反应完成后,用等体积酚/氯仿抽提,加0.1倍体积3mol/L NaAc和2倍体积无水乙醇,混匀后置-70℃低温冰箱30分钟,离心、干燥并重新溶于缓冲液后进行第二个酶切反应。

⑸ 限制性内切酶切割DNA双链后 可产生哪些切口 各有什么特点

当限制性内切酶作用于特定的DNA时,把这段序列沿着特定的切点切开的这个过程分两种情况:
a:沿着中轴线切口(即沿着DNA双链中对应的磷酸二酯键)切开,得到的就是两个平末端;
b:在中轴线的两端切口切开,得到的就是两个黏性末端。 例如:EcoRI限制性内切酶就可以识别G/AATTC的DNA序列,然后在G和A间切开,得到的就是两个黏性末端(之间可以根据碱基互补配对原则重组)
限制酶的切口不都是一长一短的, 一长一短的叫黏性末端,一样长的叫平末端.

⑹ dna限制性内切酶酶切时,有哪些注意事项

1)购买的限制性内切酶 带有两种不同的酶切缓冲液,该用哪一种
每种限制性内切酶 带有一管酶的最适反应液(通常是一种4-CORE反应液),可能还带有一只MULTI-CORE反应液。

⑺ 酶切的基本步骤

1) 成功酶切的关键是准备好模板DNA。DNA样品中不能含有有机溶剂(会使酶变性或产生星号货性),不能含有干扰酶活性的污染物质,不能含有高浓度的EDTA (TE中的EDTA浓度较低,对Mg的浓度影响较小);同时要对DNA甲基化程度及其对酶切效率的影响要做到心中有数。
2) 选用合适的酶。根据酶切序列选用,特别注意选用甲基化对酶活性的干扰。
3) 正确使用和保存酶。酶需要保存在-20度的低温环境中,只是在需要用酶才从冰箱中取出来。运输和临时存放时需要将酶至于冰上。手拿酶管时不要接触酶管下步含酶的部分,移酶时尽可能用长TIP, 避免污染。用完后需要及时送回原处。注意:酶通常是最后加。所有
4) 反应体积需要根据实验目的定,常规的酶切一般要维持在10-50ul,酶切鉴定 10-20ul就可以了。
5) 模板浓度问题:浓度过高,溶液黏度过大,酶不能有效扩散,酶切效果不会好。浓度过低,也会影响酶活性。
详细的方法可以到生物帮上面了解下,丁氧基肼基甲酸酯保护性氨基酸单体及衍生物

⑻ 限制性核酸内切酶切割的原理和方法是什么

限制性核酸内切酶切割的原理:限制性核酸内切酶作用于双链DNA的磷酸二酯键,这种酶能识别特定的碱基序列,并且有特定的切割位点。

不同的限制性内切酶作用方式都不一样。不过大体来说,限制性内切酶都能够特异性识别并结合核酸的特殊反向回文序列(Inverted repeat palindromes ),然后催化断裂核苷酸链。

⑼ DNA限制性内切酶酶切的DNA限制性内切酶酶切原理

限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:
Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP的存在。Ⅰ类酶结合于识别位点并随机的切割识别位点不远处的DNA,而Ⅲ类酶在识别位点上切割DNA分子,然后从底物上解离。
Ⅱ类由两种酶组成: 一种为限制性内切核酸酶(限制酶),它切割某一特异的核苷酸序列; 另一种为独立的甲基化酶,它修饰同一识别序列。Ⅱ类中的限制性内切酶在分子克隆中得到了广泛应用,它们是重组DNA的基础。绝大多数Ⅱ类限制酶识别长度为4至6个核苷酸的回文对称特异核苷酸序列(如EcoRⅠ识别六个核苷酸序列:5'- G↓AATTC-3'),有少数酶识别更长的序列或简并序列。Ⅱ类酶切割位点在识别序列中,有的在对称轴处切割,产生平末端的DNA片段(如SmaⅠ:5'-CCC↓GGG-3');有的切割位点在对称轴一侧,产生带有单链突出末端的DNA片段称粘性末端,如EcoRⅠ切割识别序列后产生两个互补的粘性末端。
示意图:
5'…G↓AATTC…3' →5'… G AATTC…3'
3'…CTTAA↑G …5' →3'… CTTAA G…5'

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