国有生产企业(非房地产开发企业)转让以行政划拨方式取得的土地使用权，转让时需要补缴土地出让金，取得转让收入后，要按规定缴纳转让环节的营业税及附加税。该企业转让该土地使用权应纳税费、土地增值税的计算及会计处理如下：
(1)补缴土地出让金时：
借：无形资产
贷：银行存款
(2)取得转让收入时：
借：银行存款
贷：其他业务收入
(3)计提转让环节应缴的营业税及附加税时：
借：其他业务支出
贷：应交税金——应交营业税等
(4)计提应缴土地增值税时：
增值额土地出让收入-土地出让金-出让环节交纳的营业税及附加
增值率=增值额÷（土地出让收入-增值额）×100％
应纳税额=增值额×税率-（土地出让收入-增值额）×速算扣除系数
借：其他业务支出
贷：应交税金——应交土地增值税
(5)结转无形资产成本时：
借：其他业务支出
贷：无形资产
(6)缴纳土地增值税及有关税金时：
借：应交税金——应交土地增值税
——应交营业税等
贷：银行存款
(7)结转转让成本时：
借：其他业务收入
贷：其他业务支出
(8)结转利润时：
借：其他业务收入
贷：本年利润
『贰』 土地增值税扣除项目中“土地出让金”、“房屋开发成本”这两项中“房屋开发成本”扣除项目是否包含了土地
第六条 计算增值额的扣除项目：
（一）取得土地使用权所支付的金额；
（二）开发土地的成本、费用；
（三）新建房及配套设施的成本、费用，或者旧房及建筑物的评估价格；
详：http://ke..com/view/955290.htm
（四）与转让房地产有关的税金；
『叁』 原划拨土地使用权办理出让，土地出让金如何收取
申请
交易双方提出转让、受让申请交易当事人申请办理转让手续同时，还应提供转让协议、土地使用证、宗地界址点图、建筑物产权证明、法人资格证明，委托书、身份证明等资料。
受理和审查
市、县国土资源管理部门受理申请后，应当依据相关规定对申请人提交的申请材料进行审查，并就申请地块的土地用途等征询规划管理部门意见。经审查，申请地块用途符合规划，并且符合办理协议出让手续条件的，市、县国土资源管理部门应当组织地价评估，确定应缴纳的土地出让金额，拟订协议出让方案。
地价评估
市、县国土资源管理部门应当组织对申请转让地块的出让土地使用权市场价格和划拨土地使用权权益价格进行评估，估价基准期日为拟出让时点。
确定出让金，拟订出让方案
市、县国土资源管理部门或国有土地使用权出让协调决策机构应当根据土地估价结果、产业政策和土地市场情况等，集体决策、综合确定办理出让手续时应缴纳土地使用权出让金额，并拟订协议出让方案。应缴纳土地使用权出让金额应当按下式核定：
（1）转让后不改变用途等土地使用条件的：应缴纳的土地出让金=拟出让时的出让土地使用权市场价格-拟出让时的划拨土地使用权权益价格
（2）转让后改变用途等土地使用条件的：应缴纳的土地出让金=拟出让时的新土地使用条件下出让土地使用权市场价格-拟出让时的原土地使用条件下划拨土地使用权权益价格
方案报批，发出准予转让通知书
市、县国土资源管理部门应当按照规定，将协议出让方案报市、县人民政府审批。协议出让方案批准后，市、县国土资源管理部门应向申请人发出《划拨土地使用权准予转让通知书》。通知书内容包括：准予转让的标的、原土地使用权人、转让确定受让人的要求、受让人的权利、义务、应缴纳的土地出让金等。
公开交易
取得《划拨土地使用权准予转让通知书》的申请人，应当将拟转让的土地使用权在土地有形市场等场所公开交易，确定受让人和成交价款。
签订转让合同
通过公开交易确定受让方和成交价款后，转让人应当与受让人签订转让合同，约定双方的权利和义务，明确划拨土地使用权转让价款。
办理出让手续
受让人应在达成交易后10日内，持转让合同、原土地使用证、准予转让通知书、转让方和受让方的身份证明材料等，向市、县国土资源管理部门申请办理出让手续。市、县国土资源管理部门应当按照批准的协议出让方案、公开交易情况等，依法收回原土地使用权人的划拨决定书，注销土地登记，收回原土地证书，与受让方签订出让合同。
『肆』 土地增值税中土地出让金已抵扣的税需要扣减吗
土地增值税中，土地出让金已抵扣的税，不需要扣减。缴纳的税需要扣减。
房地产专公司计算土地增值税时，属如果外购土地进项税已经抵扣，则按不含税金额填报，如果不涉及进项税抵扣的，按土地使用权而实际支付（补交）的土地出让金（地价款）及按国家统一规定交纳的有关费用的数额填写。
依据是财税〔2016〕43号 三、土地增值税纳税人转让房地产取得的收入为不含增值税收入。
《中华人民共和国土地增值税暂行条例》等规定的土地增值税扣除项目涉及的增值税进项税额，允许在销项税额中计算抵扣的，不计入扣除项目，不允许在销项税额中计算抵扣的，可以计入扣除项目。
土地增值税清算表填报，税总函〔2016〕309号 :第6栏“取得土地使用权所支付的金额”，按纳税人为取得该房地产开发项目所需要的土地使用权而实际支付（补交）的土地出让金（地价款）及按国家统一规定交纳的有关费用的数额填写。
『伍』 因转让土地使用权补交的土地出让金确认为无形资产
根据《企业会计准则第6号--无形资产》第七条规定：外购无形资产的成本，包括购专买价款、相关税费以属及直接归属于使该项资产达到预定用途所发生的其他支出。
因此，补缴土地出让金，应当计入“无形资产”科目。
补缴土地出让金时：
借：无形资产 -土地使用权
贷：银行存款
无形资产-土地使用权处置时，补缴土地出让金，应当不予进行无形资产摊销。
根据《企业会计准则第6号--无形资产》第二十二条规定：企业出售无形资产，应当将取得的价款与该无形资产账面价值的差额计入当期损益。
因此，企业出售无形资产时，应按实际收到的金额，借记“银行存款”等科目，按已计提的累计摊销，借记“累计摊销”科目，原已计提减值准备的，借记“无形资产减值准备”科目，按应支付的相关税费，贷记“应交税费”等科目，按其账面余额，贷记“无形资产”科目，按其差额，贷记“营业外收入——处置非流动资产利得”科目或借记“营业外支出——处置非流动资产损失”科目。
借：银行存款
借：累计折旧
借：无形资产减值准备
借：营业外支出（或贷：营业外收入）
贷：无形资产-土地使用权
贷：应交税费
『陆』 转让土地使用权 土地出让金可以扣除吗
《财抄政部国家税务总局袭关于营业税若干政策问题的通知》（财税〔2003〕16号）规定：单位和个人销售或转让其购置的不动产或受让的土地使用权，以全部收入减去不动产或土地使用权的购置或受让原价后的余额为营业额。
土地使用权的受让原价包括已缴纳的土地出让金，纳税人转让土地使用权可以从收入中减除土地出让金差额缴纳营业税。
『柒』 国有土地划拨转出让补交的土地出让金可否在土地增值税税前扣除
根据《国家税务总局土地增值税宣传提纲》(国税函发[1995]110号)第五条规定，土地增值税的征税对象是转让国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物所取得的增值额。增值额为纳税人转让房地产的收入减除《条例》规定的扣除项目金额后的余额。扣除项目按《条例》及《细则》规定有下列几项，其中第一项为取得土地使用权所支付的金额。包括纳税人为取得土地使用权所支付的地价款和按国家统一规定交纳的有关费用。具体为：以出让方式取得土地使用权的，为支付的土地出让金；以行政划拨方式取得土地使用权的，为转让土地使用权时按规定补交的出让金；以转让方式取得土地使用权的，为支付的地价款。因此，国有土地划拨转出让补交的土地出让金作为取得土地使用权所支付的金额，在计算土地增值税时扣除。
『捌』 土地使用权的转让要交纳土地出让金
土地转让是不用交出让金的，因为在首次出让时（土地一级市场）已经交过了；不过你可以看看土地证，如果上面显示划拨的话，就需要缴纳了，如果显示出让就不需要交了。。
『玖』 转让土地使用权计征营业税是否扣除土地出让金
理解正确，应该扣除。