1. 工业企业转让土地使用权及其地上建筑物，土地增值税如何清算
土地增值税是指来转让国有土地使自用权、地上的建筑物及其附着物并取得收入的单位和个人，以转让所取得的收入包括货币收入、实物收入和其他收入为计税依据向国家缴纳的一种税赋，不包括以继承、赠与方式无偿转让房地产的行为。纳税人为转让国有土地使用权及地上建筑物和其他附着物产权、并取得收入的单位和个人。课税对象是指有偿转让国有土地使用权及地上建筑物和其他附着物产权所取得的增值额。土地价格增值额是指转让房地产取得的收入减除规定的房地产开发成本、费用等支出后的余额。土地增值税实行四级超额累进税率。
2. 这法条如何理解：土地使用权转让时,其地上建筑物、其他附着物所有权随之转让。
这是抄一个亘古不灭的原则袭“地随物走，物随地走”。
土地使用权属于谁，地上建筑物就属于谁，如果出现两个权利主体，这就说明有错误了，不是土地局登记错误，就是房产局登记错误。但一般不会出现，开发商在拿地后，建造房屋，房屋建成后卖给小业主，就会申请制作小产证，届时土地局和房产局会把土地、房屋的大产证分割后登记的。
我比较赞成上海市的作法，将房屋和土地行政管理部门合成一家，只制作房产权证，既包含土地权属登记，也包含房屋权属登记，不会搞错。
上海市房屋土地资源管理局政策法规处
3. 第二十三条 土地使用权转让时，其地上建筑物、其他附着物所有权随之转让的解释和细节说一下
住宅用地分为集体土地和国有土地，集体土地（即农民的宅基地）法律规定是不允回许转让的，答如果是集体土地住宅转让那就不受法律保护；对于国有土地住宅，其实在物权法出台之前，我国的房地产方面法律就规定房地不可分割，必须同时转让。这是一个亘古不灭的原则“地随物走，物随地走”。
土地使用权属于谁，地上建筑物就属于谁，如果出现两个权利主体，这就说明有错误了，不是土地局登记错误，就是房产局登记错误。但一般不会出现，开发商在拿地后，建造房屋，房屋建成后卖给小业主，就会申请制作小产证，届时土地局和房产局会把土地、房屋的大产证分割后登记的。
4. 刑事案件非法转让土地使用权地上建筑物怎么算违法所得
根据《土地管理法》第73条的规定，买卖或者以其他形式非法转让土地的，由版县级以上人民政府土地行政主权管部门没收违法所得。而违法所得如何计算，实践中要注意以下三个方面：一是违法所得是否包含土地本身，二是违法所得是否包含地上建筑物的价值，三是违法所得是否包含转让方原取得用地的成本和开发用地的成本。全国人大法工委、原国家土地管理局针对湖北、广东等地国土资源主管部门有关请示作出过明确答复，即违法所得不包含土地本身，也不包含地上建筑物的价值（在土地与地上建筑物同时转让时，应扣除地上建筑物的价值部分），但转让方原取得用地的成本（如征地费用）和开发用地的成本（对土地的投入）不从违法所得中扣除。
5. 转让外购的土地使用权及地上建筑物，可否差额交增值税
不能，不属差额征税范围
6. 根据物权法，土地使用权转让时,其地上建筑物、其他附着物所有权随之转让，如果有人恶意分别转让怎么办
楼主反映的是房地产方面的问题，我是学土地的，从房地产方面解答一下楼主的问题吧
住宅用地分为集体土地和国有土地，集体土地（即农民的宅基地）法律规定是不允许转让的，如果是集体土地住宅转让那就不受法律保护；楼主说的应该是国有土地上住宅的转让。
对于国有土地住宅，其实在物权法出台之前，我国的房地产方面法律就规定房地不可分割，必须同时转让。
A将房屋转让给B，根据法律规定，房屋价格中就包含了土地价格；像市场上出售的商品房3000元/平方米或者6000元/平方米，都是包含土地价格在内的房地产的售价。同时A又将土地转让给C，进行土地使用权转让时必须明确地上建筑物残值是否包含在内；如果买方只买土地使用权，则原房主应拆除房屋后转让土地或声明房屋不要钱了；否则土地价格就是包含了房屋残值在内的价格。总之一句话，地不离房，房不离地，房地产不可分割，必须同时转让。
案例中A却将房地产分割开来，涉嫌将房屋和土地卖出两次，应属于诈骗行为。如B、C都不知情，则都属于受害者，可以要求法院追究A的诈骗罪，讨回自己的损失。
关于应保护B、C中谁的利益，如果不是同一天，则应保护先买的那个；但案中是同一天时间不分先后，法律应没有这方面的规定，具体要看法院协调吧
7. 以出售方式转让国有土地使用权和地上建筑物的需要交纳哪些税费
出售国有土地使用权和地上建筑物需要缴纳的税种有：营业税及附加、土地增值税、印花税、企业所得税（根据公司的企业所得税前利润确定）等。
8. 土地使用权转移地上建筑物所有权是否随之转移
按照我国《房地产管理法》的相关规定，房屋所有权转让，及对应的土地使用权也就随之转移。
换句话说，也就是房随地走，地随房走。 房屋的所有权和土地的使用权是不能分开转移的。
9. 小企业转让土地使用权，若土地使用权与地上建筑物及其附着物一并在固定资产科目核算的，
这个计入固定资产清理科目。如果是房地产企业 就是营业税金及附加，
希望回答对你有帮助，望采纳谢谢