A. 總公司與分公司之間合同糾紛
問題描述不清。總公司與分公司之間的合同對第三人是沒有效力的，總分之間的關系，相當於家長和不慢16歲孩子的關系。如果想妥善保護總公司利益，應慎重選擇分公司經理，並完善相關監督制度。
B. 和分公司發生糾紛可以告總公司嗎
和分公司發生糾紛一般可以告總公司。分公司不具有法人資格，其民事責任由總公司承擔。雖然依法設立並領取營業執照的分公司可以作為民事訴訟的主體，但當事人可以直接以承擔民事責任的總公司為被告提起訴訟。
【法律依據】
《最高人民法院關於適用的解釋》第五十三條法人非依法設立的分支機構，或者雖依法設立，但沒有領取營業執照的分支機構，以設立該分支機構的法人為當事人。《中華人民共和國公司法》第十四條公司可以設立分公司。設立分公司，應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。公司可以設立子公司，子公司具有法人資格，依法獨立承擔民事責任。
C. 同一個公司下的兩個分公司之間發生經濟糾紛可以互相起訴嗎
分公司的責任是由總公司承擔的，分公司不具備獨立的法人資格。自己起訴自己，不行的。
D. 和分公司發生經濟糾紛，可以起訴總公司嗎
不可以，分公司具有獨立的法人資格，依法獨立承擔責任。
《公司法》第十三條 公司可以設立分公司，分公司不具有企業法人資格，其民事責任由公司承擔。
公司可以設立子公司，子公司具有企業法人資格，依法獨立承擔民事責任。
E. 和分公司發生經濟糾紛，可以起訴總公司嗎
可以，但是不需要，如果跟子公司發生經濟糾紛，一般不一同起訴母公司。子公司具有獨立的法人資格，依法獨立承擔責任。
法律依據：
《公司法》
第十四條 公司可以設立分公司。設立分公司，應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。
公司可以設立子公司，子公司具有法人資格，依法獨立承擔民事責任。
(5)分公司和總公司之間的糾紛擴展閱讀：
經濟糾紛的解決方式：訴訟
一、經濟訴訟概述
（一）經濟訴訟的概念和任務
經濟訴訟是指人民法院在經濟糾紛當事人和其他訴訟參與人的參加下，審理和解決經濟糾紛案件的訴訟活動，以及由此而產生的訴訟法律關系的總和。
經濟訴訟的任務是保護當事人行使訴訟權利，保證人民法院查明事實，分清是非，正確適用法律，及時審理經濟糾紛案件，確認經濟權利義務關系，制裁經濟違法行為，保護當事人的合法經濟權益，維護社會秩序、經濟秩序，保障社會主義建設事業的順利進行。
（二）經濟訴訟的主體
1、人民法院
人民法院是國家的審判機關，在經濟訴訟中，它代表國家依法行使審判權並履行相應的職責。作為案件的審判者，人民法院在經濟訴訟中既是訴訟的參加者，也是訴訟的組織者和指揮者。
法律賦予人民法院審判權，使其可以依照法律規定的程序和方式進行活動，依法行使訴訟權利和履行訴訟義務。所以，人民法院在經濟訴訟中處於主導地位，對經濟糾紛案件的解決起著決定性作用。
2、訴訟當事人
經濟訴訟的當事人，是指因經濟權益發生糾紛，以自己的名義參加訴訟，受人民法院裁判拘束，與案件審理結果有直接利害關系的公民、法人和其他組織。當事人主要有原告、被告和第三人。
原告，是指因自己的經濟權益受到侵害或者與他人發生經濟權益爭議，以自己的名義向人民法院起訴並引起訴訟程序發生的人。
被告，是指被訴稱侵害了原告合法經濟權益或與原告發生經濟權益爭議而被人民法院通知應訴的人。
第三人，是指對原告和被告爭議的訴訟標的即原、被告所爭議的經濟實體權利，具有獨立的請求權，或者雖無獨立的請求權，但案件的處理結果與其有法律上的利害關系，而參加到訴訟中來的人。
第三人可分為有獨立請求權的第三人和無獨立請求權的第三人兩種。當事人作為經濟訴訟的主體，其訴訟行為對經濟訴訟有重大影響。
3、訴訟代理人
訴訟代理人是指根據訴訟代理權，以被代理的當事人的名義進行經濟訴訟的人。
訴訟代理人參加訴訟，是為了維護被代理的當事人的利益。訴訟代理人在代理許可權范圍內所為的訴訟行為，視為當事人的行為，對被代理的當事人發生法律效力。
4、其他訴訟參與人
其他訴訟參與人是指除上述人員以外其他參與訴訟活動的人。包括證人、鑒定人、勘驗人、翻譯人員等。它們雖以自己的名義參與訴訟，但與案件沒有直接利害關系，不受人民法院裁判拘束，只是根據案件審理需要，依法履行一定訴訟義務，協助人民法院完成審判活動。
經濟訴訟的基本原則
經濟訴訟的基本原則，是指法律規定的在整個經濟訴訟過程中起指導作用的基本准則。它是人民法院進行審判活動和經濟訴訟當事人和其他訴訟參與人進行訴訟活動所必須遵守的行為准則。經濟訴訟的基本原則包括訴訟共同性的原則和特有的原則。就特有原則而言，主要有：
1、當事人訴訟權利平等原則；
2、法院調解原則 ；
3、處分原則；
4、辯論原則；
5、支持起訴原則；
6、同等原則和對等原則；
7、檢察監督原則。
經濟案件的受案范圍
經濟案件的受案范圍，是指哪些經濟糾紛案件由人民法院受理。確定人民法院對經濟案件的收案范圍可以明確人民法院與仲裁機構和有關行政部門之間受理經濟糾紛案件分工和許可權。
依照法律規定，人民法院受理平等主體的法人之間、其他組織之間、公民之間以及他們相互之間因財產關系發生的經濟權益糾紛案件。主要包括各種合同糾紛案件和經濟損害賠償糾紛案件。
F. 分公司，起訴時是起訴總公司還是分公司
分公司違約後跑了，應該起訴總公司。因為分公司不具有獨立的法人資格，不能獨立承擔民事主體資格。
分公司是指在業務、資金、人事等方面受本公司管轄而不具有法人資格的分支機構。分公司屬於總公司的分支機構，在法律上、經濟上沒有獨立性，只是總公司的附屬機構，以總公司的資產對分公司的債務承擔法律責任。因此，分公司不具有法人資格，同時也不具有民事主體資格。
《公司法》第14條規定：公司可以設立分公司。設立分公司，應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。公司可以設立子公司，子公司具有法人資格，依法獨立承擔民事責任。
G. 分公司與總公司的訴訟地位及管轄法院
均不可以。只能在分公司所在地起訴。/正合法律所
H. 和分公司發生糾紛是否可以起訴總公司
分公司不具有企業法人資格，其民事責任由公司承擔。
分公司只是總公司的分支機構，不具有法人資格，無論如何其最後的責任都是由總公司承擔，既然要承擔最終的法律責任，那麼把總公司列為被告是必然可以的。
【法律依據】
《公司法》第十四條：公司可以設立分公司。設立分公司，應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。
分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。公司可以設立子公司，子公司具有法人資格，依法獨立承擔民事責任。
I. 總公司和分公司不在一個地方，怎麼起訴
當事人可以在侵權地區的法院提出訴訟。
《民事訴訟法》：
第二十三條因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。
第二十八條 因侵權行為提起的訴訟，由侵權行為地或者被告住所地人民法院管轄。