您好，股權轉讓協議來的自認定應以股東意思自治為原則，只要協議不違反法律上禁止轉讓的規定，就具有法律效力。工商登記並不是股權轉讓協議的生效要件，未經登記並不能認定股權轉讓協議無效，只是不能產生對抗善意第三人的效力。
2. 股權轉讓一定要進行工商變更登記嗎
根據《合同法》第44條之規定：「依法成立的合同，自成立時生效。
法律、行政法規規定應當辦理批准、登記等手續生效的，依照其規定。
」據此，股權轉讓人與受讓人意思表示一致合同成立，在沒有其他法律法規規定應辦理登記手續才能生效的情況下，他們的之間的股權轉讓也就發生了法律效力。
所以，股東之間，股東與非股東之間進行股權轉讓可以直接適用《合同法》。
《公司登記管理條例》第三十一條雖然要求有限責任公司變更股東應當申請變更登記，但從該條規定內容的分析，不能得出股權變動以工商變更登記為準的推論,「有限責任公司變更股東的，應當自股東變動之日起三十日內申請變更登記，並應當提交新股東的法人資格證明或自然人的身份證明。
」從中可見變更登記是以「股東變動」為條件的，而股東變動顯然是以股權發生轉移為基礎的，沒有股權的股東並不存在，沒有按期進行變更登記的法律責任只是被責令限期辦理或被處以行政罰款，但並不能夠否認新股東(受讓人)享有的股權。
股東變更登記其實只是工商行政管理部門對公司進行的一種工商行政管理行為，它本身只具有確認股權轉讓的功能，而不決定股權轉讓是否有效。
新《公司法》第七十二條的規定進一步證明股權轉讓的效力取決於是否進行過工商登記。
有限責任公司的股東之間可以相互轉讓其全部或者部分股權。
股東向股東以外的人轉讓股權，應當經其他股東過半數同意。
股東應就其股權轉讓事項書面通知其他股東徵求同意，其他股東自接到書面通知之日起滿三十日未答復的，視為同意轉讓。
其他股東半數以上不同意轉讓的，不同意的股東應當購買該轉讓的股權;不購買的，視為同意轉讓。
綜上所述，工商變更登記與否不影響股權轉讓的效力。
股權轉讓的辦理流程：有限公司的股權轉讓一般要經過如下程序：第一步，股東會決議向股東以外的第三人轉讓股權的，由轉讓股權的股東提交股東會討論表決;股東之間轉讓股權的，不需經過股東會表決同意，只要通知公司及其他股東即可。
第二步，簽訂轉讓協議雙方簽訂股權轉讓協議，對轉讓股權的數額、價格、程序、雙方的權利和義務做出具體規定，使其作為有效的法律文書來約束和規范雙方的行為。
第三步，公司向新股改出具出資證明，並辦理工商變更登記發給新股東出資證明，將新股東的姓名或名稱，住所地及受讓的出資額記載於股東名冊，並相應修改公司章程。
將新修改的公司章程，股東及其出資變更等向工商行政管理部門進行工商變更登記。
至此，有限責任公司股權轉讓的法定程序才告完成。
綜上，當事人之間如欲股權轉讓的，當事人首先要簽訂股權協議，其次，股權轉讓行為還必須符合公司章程的約定，最後，還涉及辦理工商登記等事項。
3. 股權轉讓可以不在工商變更嗎
只要依法受讓了股權或者履行了出資義務，就可以確認股東身份，工商變更登記回不具有創設股東資答格的效力。但工商變更登記屬於向社會進行公示，如果沒有辦理股權轉讓的工商變更登記，則不能對抗善意第三人，第三人仍以工商登記的信息認可股東，如果原股東因訴訟，其股權被查封的，可能導致受讓方無法取得股權。
4. 公司股權轉讓到工商部門辦理登記需要哪些材料
您好，股權變更登記，有限責任公司需要向工商部門提交下列材料:
（一）、版法定代表人簽署的《權公司變更登記申請書》；
（二）、企業申請變更登記委託書（公司簽署的指定代表或者委託代理人的身份證明）；
（三）、股東會會議決議；
（四）、公司章程修正案；
（五）、股權轉讓協議或者股權交割證明；
（六）、向原股東以外的人轉讓的，提交新股東的主體資格證明；
（七）、企業法人營業執照正本(原件1份)或副本(原件)。
如能給出詳細信息，則可作出更為周詳的回答。