⑴ 限制性酶酶切DNA有幾種方式
第一、二、三類,其中常用為第二類限制性內切酶,酶切活性在正常條件下只有一種,在非正常條件如濃度過大、非最適溫度、離子條件不適宜時,會表現出非正常酶切活性,即切點發生變化,即星活性。
⑵ 常用的酶切有哪些方法
常用的酶切方法有單酶切、雙酶切和部分酶切等幾種。(1)單酶切法:這是用一種限制性內切核酸酶酶切DNA樣品。若DNA樣品是環狀DNA分子,完全酶切後,產生與識別序列數(n)相同的DNA片段數,並且DNA片段的兩末端相同。若DNA樣品本來就是線形DNA片段,完全酶切的結果,產生n+1個DNA片段數,其中有兩個片段的一端仍保留原來的末端。
(2)雙酶切法:這是用兩種不同的限制性內切核酸酶酶切同一種DNA分子的方法。DNA分子無論是環狀DNA分子,還是線形DNA片段,酶切結果,DNA片段的兩個黏性末端是不同的(用同尾酶酶切除外)。環狀DNA分子完全酶切的結果,產生的DNA片段數是兩種限制性內切核酸酶識別序列數之和。線形DNA片段完全酶切的結果,產生的DNA片段數是兩種限制性內切核酸酶識別序列數之和加1。
(3)部分酶切:部分酶切指選用的限制性內切核酸酶對其在DNA分子上的全部識別序列進行不完全的酶切。導致部分酶切的原因有底物DNA的純度低、識別序列的甲基化、酶用量不足、反應時間不夠以及反應緩沖液和溫度不適宜等。部分酶切會影響需要的DNA片段的得率。但是從另一方面說,有時根據重組DNA的需要,還專門創造部分酶切的條件,以獲得需要的DNA片段。
圖4-2:DNA酶切電泳圖
⑶ DNA的限制性酶切及電泳分析實驗方法.
1. 反應體系的建立:⑴ 在一無菌1.5 ml Eppendorf管中加入:�無菌雙蒸水 7 μl�10×酶切緩沖液 2 μl�質粒DNA(100 ng/μl) 10 μl�EcoRⅠ(5 U/μl) 1 μl�總體積為20μl⑵ 輕輕混勻,12000 rpm離心5 sec。2. 37 ℃水浴1 h。3. 將Eppendorf管置65 ℃水浴中10 min,通過加熱使酶失活以終止反應。4. 12000 rpm離心5 sec,將管蓋及管壁上的水離下。5. 取10 μl消化產物,與2 μl 6×上樣緩沖液混勻,瓊脂糖凝膠電泳檢測消化效果,電泳條件:約100 V 30~60 min。6 結果觀察。操作注意事項:1. 吸樣量一定要准確2. 為了不使酶污染而導致浪費,最後才加酶3. 要求在冰上操作,並充分混勻,4. 開啟Eppendorf管時,手不要接觸到管蓋內面,以防污染。5. 樣品在37 ℃與65 ℃保溫時,將離心管蓋嚴,以防水進入管內造成實驗失敗。限制性內切酶酶解中常見的問題和原因1. DNA完全沒有被限制性內切酶切割:①限制性內切酶失活;②DNA不純,含有SDS、有機溶劑、EDTA等;③非限制性內切酶最佳反應條件;④酶切位點被修飾;⑤DNA上不存在該酶的識別順序。2. DNA切割不完全:①限制性內切酶活性下降或稀釋不正確;②DNA不純或反應條件不佳;③酶切位點被修飾;④部分DNA溶液粘在管壁上;⑤酶切後DNA粘末端退火。3. DNA片段數目多於理論值:①限制性內切酶星號活力;②存在第二種限制性內切酶污染;③樣品DNA中含有其它DNA。 可以到生物幫上查找這方面的信息啊,那裡擁有生物領域內豐富的資源,有空的話,可以去 www.bio1000.com/zt/dna/164670.html 那裡看下啊。
⑷ DNA限制性內切酶酶切的影響因素
當微量的污染物進入限制性內切酶貯存液中時,會影響其進一步使用,因此在吸取限制性內切酶時,每次都要用新的吸管頭。如果採用兩種限制性內切酶,必須要注意分別提供各自的最適鹽濃度。
若兩者可用同一緩沖液,則可同時水解。
若需要不同的鹽濃度,則低鹽濃度的限制性內切酶必須首先使用,隨後調節鹽濃度,再用高鹽濃度的限制性內切酶水解。也可在第一個酶切反應完成後,用等體積酚/氯仿抽提,加0.1倍體積3mol/L NaAc和2倍體積無水乙醇,混勻後置-70℃低溫冰箱30分鍾,離心、乾燥並重新溶於緩沖液後進行第二個酶切反應。
⑸ 限制性內切酶切割DNA雙鏈後 可產生哪些切口 各有什麼特點
當限制性內切酶作用於特定的DNA時,把這段序列沿著特定的切點切開的這個過程分兩種情況:
a:沿著中軸線切口(即沿著DNA雙鏈中對應的磷酸二酯鍵)切開,得到的就是兩個平末端;
b:在中軸線的兩端切口切開,得到的就是兩個黏性末端。 例如:EcoRI限制性內切酶就可以識別G/AATTC的DNA序列,然後在G和A間切開,得到的就是兩個黏性末端(之間可以根據鹼基互補配對原則重組)
限制酶的切口不都是一長一短的, 一長一短的叫黏性末端,一樣長的叫平末端.
⑹ dna限制性內切酶酶切時,有哪些注意事項
1)購買的限制性內切酶 帶有兩種不同的酶切緩沖液,該用哪一種
每種限制性內切酶 帶有一管酶的最適反應液(通常是一種4-CORE反應液),可能還帶有一隻MULTI-CORE反應液。
⑺ 酶切的基本步驟
1) 成功酶切的關鍵是准備好模板DNA。DNA樣品中不能含有有機溶劑(會使酶變性或產生星號貨性),不能含有干擾酶活性的污染物質,不能含有高濃度的EDTA (TE中的EDTA濃度較低,對Mg的濃度影響較小);同時要對DNA甲基化程度及其對酶切效率的影響要做到心中有數。
2) 選用合適的酶。根據酶切序列選用,特別注意選用甲基化對酶活性的干擾。
3) 正確使用和保存酶。酶需要保存在-20度的低溫環境中,只是在需要用酶才從冰箱中取出來。運輸和臨時存放時需要將酶至於冰上。手拿酶管時不要接觸酶管下步含酶的部分,移酶時盡可能用長TIP, 避免污染。用完後需要及時送回原處。注意:酶通常是最後加。所有
4) 反應體積需要根據實驗目的定,常規的酶切一般要維持在10-50ul,酶切鑒定 10-20ul就可以了。
5) 模板濃度問題:濃度過高,溶液黏度過大,酶不能有效擴散,酶切效果不會好。濃度過低,也會影響酶活性。
詳細的方法可以到生物幫上面了解下,丁氧基肼基甲酸酯保護性氨基酸單體及衍生物
⑻ 限制性核酸內切酶切割的原理和方法是什麼
限制性核酸內切酶切割的原理:限制性核酸內切酶作用於雙鏈DNA的磷酸二酯鍵,這種酶能識別特定的鹼基序列,並且有特定的切割位點。
不同的限制性內切酶作用方式都不一樣。不過大體來說,限制性內切酶都能夠特異性識別並結合核酸的特殊反向迴文序列(Inverted repeat palindromes ),然後催化斷裂核苷酸鏈。
⑼ DNA限制性內切酶酶切的DNA限制性內切酶酶切原理
限制性內切酶能特異地結合於一段被稱為限制性酶識別序列的DNA序列之內或其附近的特異位點上,並切割雙鏈DNA。它可分為三類:
Ⅰ類和Ⅲ類酶在同一蛋白質分子中兼有切割和修飾(甲基化)作用且依賴於ATP的存在。Ⅰ類酶結合於識別位點並隨機的切割識別位點不遠處的DNA,而Ⅲ類酶在識別位點上切割DNA分子,然後從底物上解離。
Ⅱ類由兩種酶組成: 一種為限制性內切核酸酶(限制酶),它切割某一特異的核苷酸序列; 另一種為獨立的甲基化酶,它修飾同一識別序列。Ⅱ類中的限制性內切酶在分子克隆中得到了廣泛應用,它們是重組DNA的基礎。絕大多數Ⅱ類限制酶識別長度為4至6個核苷酸的迴文對稱特異核苷酸序列(如EcoRⅠ識別六個核苷酸序列:5'- G↓AATTC-3'),有少數酶識別更長的序列或簡並序列。Ⅱ類酶切割位點在識別序列中,有的在對稱軸處切割,產生平末端的DNA片段(如SmaⅠ:5'-CCC↓GGG-3');有的切割位點在對稱軸一側,產生帶有單鏈突出末端的DNA片段稱粘性末端,如EcoRⅠ切割識別序列後產生兩個互補的粘性末端。
示意圖:
5'…G↓AATTC…3' →5'… G AATTC…3'
3'…CTTAA↑G …5' →3'… CTTAA G…5'