國有生產企業(非房地產開發企業)轉讓以行政劃撥方式取得的土地使用權，轉讓時需要補繳土地出讓金，取得轉讓收入後，要按規定繳納轉讓環節的營業稅及附加稅。該企業轉讓該土地使用權應納稅費、土地增值稅的計算及會計處理如下：
(1)補繳土地出讓金時：
借：無形資產
貸：銀行存款
(2)取得轉讓收入時：
借：銀行存款
貸：其他業務收入
(3)計提轉讓環節應繳的營業稅及附加稅時：
借：其他業務支出
貸：應交稅金——應交營業稅等
(4)計提應繳土地增值稅時：
增值額土地出讓收入-土地出讓金-出讓環節交納的營業稅及附加
增值率=增值額÷（土地出讓收入-增值額）×100％
應納稅額=增值額×稅率-（土地出讓收入-增值額）×速算扣除系數
借：其他業務支出
貸：應交稅金——應交土地增值稅
(5)結轉無形資產成本時：
借：其他業務支出
貸：無形資產
(6)繳納土地增值稅及有關稅金時：
借：應交稅金——應交土地增值稅
——應交營業稅等
貸：銀行存款
(7)結轉轉讓成本時：
借：其他業務收入
貸：其他業務支出
(8)結轉利潤時：
借：其他業務收入
貸：本年利潤
『貳』 土地增值稅扣除項目中「土地出讓金」、「房屋開發成本」這兩項中「房屋開發成本」扣除項目是否包含了土地
第六條 計算增值額的扣除項目：
（一）取得土地使用權所支付的金額；
（二）開發土地的成本、費用；
（三）新建房及配套設施的成本、費用，或者舊房及建築物的評估價格；
詳：http://ke..com/view/955290.htm
（四）與轉讓房地產有關的稅金；
『叄』 原劃撥土地使用權辦理出讓，土地出讓金如何收取
申請
交易雙方提出轉讓、受讓申請交易當事人申請辦理轉讓手續同時，還應提供轉讓協議、土地使用證、宗地界址點圖、建築物產權證明、法人資格證明，委託書、身份證明等資料。
受理和審查
市、縣國土資源管理部門受理申請後，應當依據相關規定對申請人提交的申請材料進行審查，並就申請地塊的土地用途等征詢規劃管理部門意見。經審查，申請地塊用途符合規劃，並且符合辦理協議出讓手續條件的，市、縣國土資源管理部門應當組織地價評估，確定應繳納的土地出讓金額，擬訂協議出讓方案。
地價評估
市、縣國土資源管理部門應當組織對申請轉讓地塊的出讓土地使用權市場價格和劃撥土地使用權權益價格進行評估，估價基準期日為擬出讓時點。
確定出讓金，擬訂出讓方案
市、縣國土資源管理部門或國有土地使用權出讓協調決策機構應當根據土地估價結果、產業政策和土地市場情況等，集體決策、綜合確定辦理出讓手續時應繳納土地使用權出讓金額，並擬訂協議出讓方案。應繳納土地使用權出讓金額應當按下式核定：
（1）轉讓後不改變用途等土地使用條件的：應繳納的土地出讓金=擬出讓時的出讓土地使用權市場價格-擬出讓時的劃撥土地使用權權益價格
（2）轉讓後改變用途等土地使用條件的：應繳納的土地出讓金=擬出讓時的新土地使用條件下出讓土地使用權市場價格-擬出讓時的原土地使用條件下劃撥土地使用權權益價格
方案報批，發出准予轉讓通知書
市、縣國土資源管理部門應當按照規定，將協議出讓方案報市、縣人民政府審批。協議出讓方案批准後，市、縣國土資源管理部門應向申請人發出《劃撥土地使用權准予轉讓通知書》。通知書內容包括：准予轉讓的標的、原土地使用權人、轉讓確定受讓人的要求、受讓人的權利、義務、應繳納的土地出讓金等。
公開交易
取得《劃撥土地使用權准予轉讓通知書》的申請人，應當將擬轉讓的土地使用權在土地有形市場等場所公開交易，確定受讓人和成交價款。
簽訂轉讓合同
通過公開交易確定受讓方和成交價款後，轉讓人應當與受讓人簽訂轉讓合同，約定雙方的權利和義務，明確劃撥土地使用權轉讓價款。
辦理出讓手續
受讓人應在達成交易後10日內，持轉讓合同、原土地使用證、准予轉讓通知書、轉讓方和受讓方的身份證明材料等，向市、縣國土資源管理部門申請辦理出讓手續。市、縣國土資源管理部門應當按照批準的協議出讓方案、公開交易情況等，依法收回原土地使用權人的劃撥決定書，注銷土地登記，收回原土地證書，與受讓方簽訂出讓合同。
『肆』 土地增值稅中土地出讓金已抵扣的稅需要扣減嗎
土地增值稅中，土地出讓金已抵扣的稅，不需要扣減。繳納的稅需要扣減。
房地產專公司計算土地增值稅時，屬如果外購土地進項稅已經抵扣，則按不含稅金額填報，如果不涉及進項稅抵扣的，按土地使用權而實際支付（補交）的土地出讓金（地價款）及按國家統一規定交納的有關費用的數額填寫。
依據是財稅〔2016〕43號 三、土地增值稅納稅人轉讓房地產取得的收入為不含增值稅收入。
《中華人民共和國土地增值稅暫行條例》等規定的土地增值稅扣除項目涉及的增值稅進項稅額，允許在銷項稅額中計算抵扣的，不計入扣除項目，不允許在銷項稅額中計算抵扣的，可以計入扣除項目。
土地增值稅清算表填報，稅總函〔2016〕309號 :第6欄「取得土地使用權所支付的金額」，按納稅人為取得該房地產開發項目所需要的土地使用權而實際支付（補交）的土地出讓金（地價款）及按國家統一規定交納的有關費用的數額填寫。
『伍』 因轉讓土地使用權補交的土地出讓金確認為無形資產
根據《企業會計准則第6號--無形資產》第七條規定：外購無形資產的成本，包括購專買價款、相關稅費以屬及直接歸屬於使該項資產達到預定用途所發生的其他支出。
因此，補繳土地出讓金，應當計入「無形資產」科目。
補繳土地出讓金時：
借：無形資產 -土地使用權
貸：銀行存款
無形資產-土地使用權處置時，補繳土地出讓金，應當不予進行無形資產攤銷。
根據《企業會計准則第6號--無形資產》第二十二條規定：企業出售無形資產，應當將取得的價款與該無形資產賬面價值的差額計入當期損益。
因此，企業出售無形資產時，應按實際收到的金額，借記「銀行存款」等科目，按已計提的累計攤銷，借記「累計攤銷」科目，原已計提減值准備的，借記「無形資產減值准備」科目，按應支付的相關稅費，貸記「應交稅費」等科目，按其賬面余額，貸記「無形資產」科目，按其差額，貸記「營業外收入——處置非流動資產利得」科目或借記「營業外支出——處置非流動資產損失」科目。
借：銀行存款
借：累計折舊
借：無形資產減值准備
借：營業外支出（或貸：營業外收入）
貸：無形資產-土地使用權
貸：應交稅費
『陸』 轉讓土地使用權 土地出讓金可以扣除嗎
《財抄政部國家稅務總局襲關於營業稅若干政策問題的通知》（財稅〔2003〕16號）規定：單位和個人銷售或轉讓其購置的不動產或受讓的土地使用權，以全部收入減去不動產或土地使用權的購置或受讓原價後的余額為營業額。
土地使用權的受讓原價包括已繳納的土地出讓金，納稅人轉讓土地使用權可以從收入中減除土地出讓金差額繳納營業稅。
『柒』 國有土地劃撥轉出讓補交的土地出讓金可否在土地增值稅稅前扣除
根據《國家稅務總局土地增值稅宣傳提綱》(國稅函發[1995]110號)第五條規定，土地增值稅的征稅對象是轉讓國有土地使用權、地上的建築物及其附著物所取得的增值額。增值額為納稅人轉讓房地產的收入減除《條例》規定的扣除項目金額後的余額。扣除項目按《條例》及《細則》規定有下列幾項，其中第一項為取得土地使用權所支付的金額。包括納稅人為取得土地使用權所支付的地價款和按國家統一規定交納的有關費用。具體為：以出讓方式取得土地使用權的，為支付的土地出讓金；以行政劃撥方式取得土地使用權的，為轉讓土地使用權時按規定補交的出讓金；以轉讓方式取得土地使用權的，為支付的地價款。因此，國有土地劃撥轉出讓補交的土地出讓金作為取得土地使用權所支付的金額，在計算土地增值稅時扣除。
『捌』 土地使用權的轉讓要交納土地出讓金
土地轉讓是不用交出讓金的，因為在首次出讓時（土地一級市場）已經交過了；不過你可以看看土地證，如果上面顯示劃撥的話，就需要繳納了，如果顯示出讓就不需要交了。。
『玖』 轉讓土地使用權計征營業稅是否扣除土地出讓金
理解正確，應該扣除。